Ministarstvo vanjskih poslova Bosne i Hercegovine uputilo je protestnu notu Hrvatskoj povodom izjave predsjednika Hrvatskog sabora Gordana Jandrokovića, koji je u javnosti izjavio da "Bosna i Hercegovina neće postojati ukoliko u njoj ne prevlada koncept tri konstitutivna naroda". Ova izjava izazvala je zabrinutost u Sarajevu, jer se smatra da direktno osporava suverenitet BiH, te implicitno podržava politiku koja favorizira etničke podjele unutar zemlje.
U protestnoj noti, Ministarstvo vanjskih poslova BiH izrazilo je svoje poštovanje prema Hrvatskoj, ali je istaknuto da izjava predsjednika Sabora nije doprinijela jačanju dobrosusjedskih odnosa između dvije zemlje. U dokumentu se podsjeća na važnost teritorijalnog integriteta i političkog suvereniteta BiH, te se naglašava da BiH, kao jedna od najstarijih država u ovom dijelu kontinenta, ima čvrstu i neupitnu budućnost. Ministarstvo vanjskih poslova BiH takođe izražava zahvalnost Hrvatskoj za kontinuiranu podršku BiH na njenom putu prema Evropskoj uniji, kao i za pomoć koja je pružena prilikom nedavnih poplava, što se smatra još jednim primjerom prijateljskih odnosa između dviju zemalja. Ipak, BiH je u noti iznijela stav da Jandrokovićeva izjava ne odražava stvarnu prirodu bilateralnih odnosa, niti doprinosi izgradnji međusobnog povjerenja.
Ubrzo nakon ove protestne note, uslijedio je odgovor Republike Hrvatske putem Ambasade Hrvatske u Sarajevu. U odgovoru se naglašava kako su sve izjave Gordana Jandrokovića, i na službenim sastancima i u javnosti, bile u duhu dobrosusjedstva i prijateljstva između Hrvatske i Bosne i Hercegovine. Hrvatska je, prema njihovim tvrdnjama, dosljedna u politici poštovanja teritorijalnog integriteta BiH i u osiguravanju jednakopravnog statusa tri konstitutivna naroda, što smatraju temeljem opstojnosti i stabilnosti BiH. U odgovoru se također ističe da je ustavna kategorija konstitutivnih naroda ključna za funkcionalnost Bosne i Hercegovine, i da je ta kategorija sadržana u Dejtonskom mirovnom sporazumu, koji je osnov za stabilnost države.
Ambasada Republike Hrvatske dodatno ističe kako je Jandroković svojim izjavama u potpunosti potvrdio posvećenost Hrvatskoj politici koja podržava euroatlantski put BiH, te smatraju da je takvo tumačenje izjava ministra vanjskih poslova BiH pogrešno i zlonamjerno. Hrvatska, kako se navodi, ostaje privržena prijateljskim odnosima s Bosnom i Hercegovinom i nastoji unaprijediti međusobne odnose na temelju uzajamnog poštovanja i suradnje.
Međutim, iako službena politika Republike Hrvatske često naglašava kako je Hrvatska "najveći prijatelj Bosne i Hercegovine" i zemlja koja pruža značajnu podršku BiH na njenom putu prema Evropskoj uniji, povijest bilateralnih odnosa često je obilježena skandalima i napetostima. Gotovo svaka posjeta visokih dužnosnika iz Hrvatske izazove neku vrstu političkog nesuglasja ili reakcija koje nanose štetu međusobnim odnosima.
Primjerice, tokom posjete premijera Hrvatske Andreja Plenkovića u januaru ove godine, uslijedio je skandal kada je Plenković izbjegao sastanak s članovima Predsjedništva Bosne i Hercegovine zbog političkog stava prema članu Predsjedništva Željku Komšiću, kojeg Plenković nije smatrao legitimnim predstavnikom Hrvata u BiH. Ova situacija izazvala je veliku političku uzbunu u Bosni i Hercegovini, jer je mnogima izgledalo kao da Hrvatska nije poštovala političku institucionalnu ravnotežu unutar BiH.
Sličnu situaciju stvorila je i izjava Gordana Jandrokovića. Iako je on na početku svoje posjete Sarajevu naglasio da dolazi kao prijatelj Bosne i Hercegovine, ubrzo su uslijedile izjave koje su, prema mnogim analitičarima i političarima u BiH, smatrane uvredljivima. Jandroković je, među ostalim, sugerirao da opstojnost BiH zavisi od prevlasti koncepta tri konstitutivna naroda, što je mnogima u BiH izgledalo kao pokušaj daljnjeg etničkog dijeljenja zemlje i smanjenja uloge i prava drugih naroda u BiH, posebice Bošnjaka. Takve izjave, smatraju politički analitičari u BiH, nisu u skladu s modernim shvaćanjem multietničke, demokratske i funkcionalne države u 21. stoljeću.
Reakcija Bosne i Hercegovine na Jandrokovićevu izjavu pokazuje duboku zabrinutost zbog sve učestalijih političkih intervencija iz susjednih zemalja koje se, prema mišljenju mnogih, ne pridržavaju principa međusobnog poštovanja i uzajamne suradnje. Bosna i Hercegovina, iako zahvalna na pomoći koju dobija od Hrvatske, traži da se u budućnosti više pažnje posveti očuvanju političke ravnoteže i suvereniteta zemlje, bez vanjskih pritisaka koji bi mogli ugroziti njen unutarnji politički sklad i stabilnost.
Na kraju, iako se službeni stav Hrvatske može tumačiti kao iskazivanje prijateljskih namjera, brojni incidenti i skandali koji prate političke posjete iz Hrvatske ostavljaju dojam da odnosi nisu uvijek utemeljeni na dubokom razumijevanju i poštovanju specifičnosti političke situacije u Bosni i Hercegovini. Ovakvi politički nesporazumi dodatno otežavaju proces izgradnje povjerenja između dviju zemalja, što je ključno za daljnji razvoj prijateljskih i suradničkih odnosa.
